Alternativní návrhy 

Alternativních návrhů k dálnici D3 Praha – Tábor – České Budějovice (resp. dále jako R3 až na hranice s Rakouskem) je několik.

Dálnice D3 téměř v celé své trase kopíruje železniční trať Praha – Tábor – České Budějovice – Horní Dvořiště (hranice Rakouska). Tato železniční trať je součástí tzv. IV. železničního koridoru, jehož modernizace je plánována na období 2003 – 2008. Po skončení této modernizace by měl vlak zdolat trasu Praha – České Budějovice (s jednou zastávkou v Táboře) rychleji než automobil po plánované dálnici D3 (při dodržování silničních předpisů). Tato železniční trať je samozřejmě využitelná též pro nákladní dopravu.

Silniční dálkovou (resp. tranzitní) dopravu lze převést na paralelní silniční trasu Praha – Příbram – Písek – České Budějovice (R4, resp. I/4 + I/20). Tato trasa je již v úseku Praha – Příbram postavena v rychlostních parametrech a výhledově má být v těchto parametrech dostavěna do Písku. Vzhledem k tomu, že celková délka trasy Praha – České Budějovice je v koridoru I/3 jen o něco málo kratší než v koridoru I/4 + I/20, je již dnes rychlejší cestovat z Prahy do Českých Budějovic přes Příbram než přes Tábor. Pokud by trasa R4 (I/4) + I/20 byla označena jako mezinárodní silnice E55 (dosud je tak značena silnice I/3), ulehčilo by se silnici přes Tábor též od mezinárodní silniční dopravy (byť ta zatím představuje malý podíl dopravy).

Pro silniční spojení Praha – Tábor lze alternativně k dálnici D3 modernizovat silnici I/3 Mirošovice – Tábor. Tato modernizace by prakticky znamenala přestavbu silnice I/3 v daném úseku na rychlostní silnici (rozšíření za dvou resp. tří pruhů na čtyři, vyvedení silnice mimo obce). Možnost využití silnice I/3 pro výstavbu rychlostí silnice ověřil na podzim roku 2000 Český a Slovenský dopravní klub – viz studie “Využitelnost silnice I/3 v úseku Praha – Tábor pro rekonstrukci na rychlostní silnici R3”.

V srpnu 2001 pak předložily obce a občanské iniciativy odbornou studii alternativy k dálnici D3 v úseku Praha - Tábor. Studie byla zaplacena z rozpočtů jednotlivých obcí, na studii se skládali též jednotliví občané a občanská sdružení. Studii zpracovala dopravně inženýrská kancelář PROMIKA z Prahy.